Развитие истории изучения двигательной активности в России официально началось с 30-х годов XX века, с работ профессора Н. А. Бернштейна. В своей книге «Очерки по физиологии движения и физиологической активности» (М.: Биомедгиз, 1947) он определил 5 уровней регулирования движения. Самый начальный этап координации движения регулируется бессознательно и подчиняется только информации, поступающей от рецепторов внешних тканей и внутренних органов.

Заслуженно получив мировое признание, на родине он, к сожалению, не смог завершить свои научные исследования. Вторая волна интереса к изучению координации движения началась после работ М. Р. Могендовича, ученика И. П. Павлова. В своей книге «Чувствительность внутренних органов» (Ленинград, 1941) Могендович описал результаты своих экспериментальных исследований.

Раздражая рецепторы внутренних органов собак, он регистрировал изменение электромиографической активности разных скелетных мышц — таким образом устанавливал функциональные связи между внутренними органами и скелетными мышцами. К сожалению, его труды были впоследствии запрещены.

Исследования продолжались также в соседних социалистических странах — Румынии и Болгарии. Результаты трудов были опубликованы в книгах Гранита Р. «Основы регуляции движений» (М., Мир, 1973) и Робеску Н. «Нейромоторное перевоспитание» (Бухарест, 1972).

Параллельно, в 1936 году, Кендалл и Кендел (США) опубликовали книгу «Мануальное мышечное тестирование». В 1966 году доктор Дж. Гудхарт разработал метод использования мануального мышечного тестирования в качестве биологической обратной связи.

Российские учёные познакомились с этим феноменом на международной конференции в Москве в 1990 году. Одним из организаторов конференции был А. Е. Саморуков (ныне президент Российской ассоциации мануальной терапии). На конференцию были приглашены представители разных высших медицинских учреждений и научно-исследовательских институтов.

В ходе конференции профессор Коган пригласил одного из ведущих учёных в области кинезиологии, доктора Дж. Шеффера (Дания), провести семинар в Новокузнецке. Обучение прошли не только практикующие врачи, но и ряд преподавателей вузов из России, Белоруссии, Украины и Казахстана.

С 1991 года по настоящее время аналогичные семинары проводятся ежегодно в различных городах и странах. С 1994 года врачи различных специальностей начали изучать основы прикладной кинезиологии в рамках циклов повышения квалификации.

Первым, кто осознал эффективность прикладной кинезиологии и поддержал её развитие на институциональном уровне, стал академик и ректор Новокузнецкого ГИДУВа профессор А. А. Лук — он выразил уверенность в том, что благодаря её развитию выиграет не только институт, но и страна в целом.

В 2000 году была зарегистрирована Межрегиональная ассоциация прикладной кинезиологии (МАПК), объединившая более 200 специалистов различного медицинского профиля. Организатором и бессменным руководителем до 2010 года была профессор Л. Ф. Васильева.

С 2005 года Министерством здравоохранения РФ была утверждена учебная программа по прикладной кинезиологии «Мануальная терапия в восстановительном лечении». В состав методов мануальной терапии, разрешённых к применению на территории России, вошли: краниосакральная терапия, вертебральная терапия и прикладная кинезиология.

В 2006 году в Москве был открыт первый в России медицинский диагностико-реабилитационный центр «Кинезиология» под руководством профессора Л. Ф. Васильевой. С 2007 года доктор Leaf (США) проводит семинары в России — его клинические разборы поражают своей точностью и скоростью восстановления нарушенных функций.

С 2011 года проводятся ежегодные международные конференции «Прикладная кинезиология в спорте» в сотрудничестве с НИИФК. С 2014 года — две такие конференции в год.

С 2010 года школа прикладной кинезиологии при Ассоциации МАПК была преобразована в ЧУ ДПО «Академия прикладной кинезиологии». Академия объединила более 10 преподавателей и разработала программу трёхлетнего обучения специалистов. Обучение проходит в России и ещё в шести зарубежных странах.